Ciao,
il sistema ETRS89 / ETRS-LAEA è una proiezione equivalente di Lambert (
http://en.wikipedia.org/wiki/Lambert_azimuthal_equal-area_projection) e quindi differisce dalla rappresentazione conforme UTM.
Le distorsioni che rilevi sono quindi "figlie" di questo cambio di proiezione: in sostanza, tutti i poligoni vengono distorti in maniera da mantenere immutati i rapporti tra le aree rappresentate e quelle del mondo reale (la cosa non avviene con il sistema UTM, dove le aree subiscono una distorsione).
Se vuoi effettuare solamente un passaggio di sistema di riferimento, ma senza avere variazioni di aspetto rispetto alla tua geometria di partenza, allora devi riferirti al codice EPSG 25832 ETRS89 / UTM zone 32N.
Ciao!
Mattia